[Avatar-Lion]

chkdsk - в итоге после ожидания примерно 30 часов ошибка номер 50! »

30 часов на проверку системного раздела - это явный признак того, что HDD либо труп, либо почти труп. А ошибка номер 50 - это стандартное поведение чек-диска при работе из-под WinPE. Это лишь означает, что он не сохранит отчёт в журнал ОС, если ничего не путаю.

боязнь убить загрузочную винду окончательно»

Найдите какой-нибудь LiveCD\DVD\USB, чтобы можно было с него загрузиться и проверить S.M.A.R.T. жесткого диска. Возможно, от вашей "загрузочной винды" остались только рожки да ножки и ее придется похоронить вместе с жестким диском. И всеми вашими данными, да.